附子是“回阳救逆第一品药”，功效、主治甚广，但如果使用不当，或发生毒性反应，轻则口腔刺痛、麻木，说话不流利，或四肢麻木；重则肌肉强直、抽搐，心律紊乱、传导阻滞，剧烈咳嗽、呼吸肌痉挛、窒息，最终因呼吸、循环系统功能衰竭死亡。

服用含附子的制剂应有较长的时间间隔，因附子在体内的半衰期约为17小时，且有一定的蓄积性；使用附子应因人而异加以考虑，如患者体虚或是哺乳期妇女、小儿、老人及患其他严重疾病的特殊人群，或是交感神经功能亢进者，使用附子易于中毒，最好以药典规定的量使用，用量要小，要慎用或不用；在使用附子时还要掌握病人的脉象，如果脉实数或洪大，症见大便热结，高热，内热外寒，鼻出血，抽搐以及房室传导阻滞者和孕妇应禁用；用药后因高温环境、热浴、饮酒、暴晒等，可引起附子作用增强而引发附子的毒性发作，给患者带来意想不到的伤害，应给患者交代清楚这些注意事项；因产地不同，附子毒性强弱不同，如云南腾冲所产附子毒性很大，是川附子毒性的8倍；附子反贝母、瓜蒌、白及、半夏、白蔹，畏犀角，均不宜联用或配伍这些药物；在煎煮汤药时，附子一定要先煎40~60分钟，口尝无麻辣感为宜，其目的是破坏附子的生物碱毒性。

为减轻附子的毒性，可考虑附子与干姜、甘草配伍，在减少附子毒性的同时，可增强其回阳救逆的功效；与蜂蜜联用时也能减缓附子的毒性，并增强止痛作用。