此次申报的研究专题包括冠心病、中风病、高血压、糖尿病、慢性肾脏病、肝病、脾胃病、血液病、艾滋病、慢性阻塞性肺病、恶性肿瘤、骨退行性病变等病种以及妇儿病、民族医、基地的管理和模式研究。专题研究资助经费最低90万元，最高420万元。专题研究周期为1~2年。

申报单位需曾承担过相关的研究课题，能够提供研究所需各种保障条件；申请人、课题牵头人必须是实际主持和从事研究工作的、具有副高级以上（含副高）技术职称的在职人员，年龄不超过60周岁；在读研究生、博士后（不包括在职研究生）不得作为牵头人；每人只能牵头申报1项，参加不能超过两项；目前正在主持省部级以上重点项目的不得作为牵头人申报；牵头人承担过2004~2007年度国家中医药管理局中医药科学技术研究专项课题，其验收结果为“撤销”的负责人不得申报。