2012年度国家科学技术奖共授奖330个项目和7位科技专家。国家最高科学技术奖获得者2人；国家自然科学奖二等奖41项；国家技术发明奖一等奖3项、二等奖74项；国家科学技术进步奖特等奖3项、一等奖22项、二等奖187项。

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　　国家自然科学奖二等奖

　　中药复杂体系活性成分系统分析方法及其在质量标准中的应用研究 

　　果德安(北京大学、中国科学院上海药物研究所)，叶敏(北京大学)，吴婉莹(中国科学院上海药物研究所)，关树宏(中国科学院上海药物研究所)，刘璇(中国科学院上海药物研究所)

　　国家技术发明奖二等奖

　　细胞膜色谱技术及其在中药筛选中的应用

　　贺浪冲(西安交通大学)，王嗣岑(西安交通大学)，杨广德(西安交通大学)，袁秉祥(西安交通大学)，李西玲(西安交通大学)，张彦民(西安交通大学)