在贮藏过程中，有一部分药材，除了外界的空气、水分、日光、温度、微生物等因素外，本身也会产生一系列的化学变化，不断改变着成分。例如四季青、虎杖等含有大量的鞣质，能在酶的作用下不断氧化，聚合生成其它物质，从而降低疗效。又如柏子仁、桃仁、郁李仁、当归、枸杞子等含有大量脂肪油、粘性糖质等成分，这些药材极易“走油”。另外，薄荷、佩兰、藿香、檀香、桔皮一类含挥发性成分的药材，贮藏过久，因香气不在而影响质量，降低疗效。反之，亦有一些药材，需经过一定时间贮藏，让其成分自然分解，以减少其毒性，或让其挥发厌人的“腥气”。如乳香，没药、阿胶等各种胶类和陈皮等品种。

    总之，中草药贮藏时间长短，不能一概而论，要根据各种药材的性质、贮藏条件而论。但从用药安全有效的角度出发，一般不宜太长。草本植物（含叶、花）一般不超过两年；木本植物（含根、茎、皮）不超过3年；果实、种子类不超过4年；矿物质不超过10年为宜。